细胞生物学网络结构
——Networks in Cell Biology
编 者:Mark Buchanan
Guido Caldarelli
Paolo De Los Rios
Francesco Rao
Michele Vendruscolo
出 版 社:CAMBRIDGE
索 书 号:Q2/N476/2010/Y
藏书地点:武大外教中心
除病毒外的所有生物都由细胞构成。自然界中既有单细胞生物,也有多细胞生物。细胞是生物体基本的结构和功能单位。细胞是生命的基本单位,细胞的特殊性决定了个体的特殊性,因此,对细胞的深入研究是揭开生命奥秘、改造生命和征服疾病的关键。细胞内部的骨架是指真核细胞中的蛋白纤维网架体系,广义的细胞骨架包括细胞核骨架(核内骨架及分裂期染色体骨架和核纤层)、细胞质骨架(微丝、微管、中间纤维和微梁)、细胞膜骨架、细胞外基质。细胞骨架的一重要特征是从细胞核到细胞膜包括某些细胞器与之发生联系,这种联系由于细胞骨架本身具有的动力学变化而呈可逆的,由于这种联系而形成的以细胞骨架系统为主体纤维网络,在其周围附着和包埋着各种其他细胞结构和一些生物大分子的细胞质基质,由于细胞骨架的动力学变化而赋予细胞质基质也呈动力学变化特征。这种基质可决定细胞器及一些生物大分子的定位及运动,因而对细胞器及一些生物大分子许多重要细胞学功能甚至整个细胞的代谢活动的调节都有密切关系。
本书共用了八章内容对细胞内部的生物学网络结构进行介绍。第一章对细胞的网络结构进行了概括性介绍,包括网络结果假说、中心法则和基因调控网络结构、蛋白质-蛋白质相互作用网络结构、代谢网络系统、信号网络系统、结构网络与细胞的功能等内容。第二章先分别介绍了原核生物和真核生物的转录调控,接着从转录调控系统的结构、进化、动态变化进行介绍。第三章从启动子的复杂性开始介绍,接着介绍了真核生物启动子的结构特点,并对转录因子和调控网络的生物信息学知识对转录因子和基因调控网络结构的关系进行详细说明。第四章:蛋白质相互作用研究的技术手段,包括蛋白质互补实验、亲和层析技术、蛋白质纯化和质谱技术、蛋白质和多肽的芯片技术、大规模相互作用的分析,以及对这些方面优劣性的比较。第五章则先介绍了标度律和网络拓扑学结构,并介绍了如何预测蛋白质的相互作用,以及从原子水平分辨率对蛋白质相互作用进行模拟研究。第六章介绍了代谢网络结构的动态变化和演变,主要介绍的内容包括细胞的代谢系统和调节,代谢系统的动态变化,计量分析,遗传扰动等知识。第七章:生物学网络结构的分层模块化:代谢网络举例说明。第八章介绍了细胞的信号网络结构,主要介绍了细胞内部的化学信号通路,以及这些信号通路之间的交谈,同时也介绍了信号网络系统的组成和调节。
本书讨论了系统生物学研究的细胞网络基础,同时也为细胞系统的定量研究打下了坚实的基础。本书可以作为生理学、生物学、生物化学专业的研究生和科研工作者的参考书,不仅介绍了细胞内部网络的理论知识,也介绍了研究这些网络结构所用的生物学方法,在理论和实验中起到了较好的平衡作用。
本书目录:
第一章:细胞的网络结构
第一节:网络结果假说
第二节:中心法则和基因调控网络结构
第三节:蛋白质-蛋白质相互作用网络结构
第四节:代谢网络系统
第五节:信号网络系统
第六节:结构网络与细胞的功能
第七节:总结
第二章:转录调控网络结构
第三章:转录因子和基因调控网络结构的关系
第一节:简介
第二节:启动子的复杂性和真核生物启动子简介
第三节:转录因子
第四节:调控网络的生物信息学知识
第四章:蛋白质相互作用研究的技术手段
第五章:蛋白质相互作用的模拟研究
第一节:简介
第二节:标度律和网络拓扑学结构
第三节:预测蛋白质的相互作用
第四节:原子水平分辨率的模拟
第五节:结论
第六章:代谢网络结构的动态变化和演变
第七章:生物学网络结构的分层模块化:代谢网络举例说明
第八章:信号网络结构
(王书珍)